КАЧЕСТВО NIPTIFY

Развитие и потверждение теста NIPTIFY началось в 2013. Точность теста была основана на 447 образцах крови от будущих матерей.

 

Trisomy No of cases
Sensitivity
Specificity
T21 15/15 100% 100%
T18 9/9* 100%* 99.3%
T13 4/4 100% 99.3%
X0 4/4 100% 99.6%

*Один случай мозаики T18 не был обнаружен (~ 20% анеуплоидных клеток).

Клиническое потверждение было проведено в Специализированом Центре по Здравохранению (CCHT) в сотрудничестве с:
– Тартуская университетская больница
– Восточно-Таллиннская центральная больница
– KU Leuven Больница
Во время клинического подтверждения риск трисомии оценивался в 447 образцах беременных женщин:
– 172 образцы от населения в целом, низкий риск трисомии, Тартуская университетская больница
– 259 образцы с высоким риском трисомии, Тартуская университетская больница и Восточно-Таллиннская центральная больница
– 16 внешний контроль качества, больница KU Leuven

Во время теста NIPTIFY исследователи не знали кариотипа плода, и метод потверждения был слепым тестом. Все беременные женщины с высоким риском трисомии прошли инвазивный анализ хромосом плода (метод биопсии хориона) в Генетическом центре Тартуской университетской больницы. Результаты NIPTIFY теста сравнивались с результатами анализа инвазивной хромосомы плода в методе слепого теста.K

Тест NIPTIFY был подтвержден на основе образцов Эстонии и Бельгии. Результаты совпали на 100%.

Ложно-положительный результаты NIPTIFY теста:

Один (1) T18 в группе низкого риска, три (3) T13 в группе низкого риска и два (2) T18 в группе высокого риска.

Ложно-положительный результаты (ЛП):
ЛП/T21 – 0%
ЛП/T13 – 0.67% (3/447)
ЛП/T18 – 0.67% (3/447)
ЛП/X0 – 0.45% (2/447)

При традиционном скрининге триместр сывороточных маркеров и УЗИ — ЛП 3-5%.

Чувствительность (Ложно-положительный/(Ложно-положительный+ Ложно-отрицательный)):
T21 – 100%
T18 – 100%
T13 – 100%
45,XO – 100%
Пол плода– 100%

Уровень выявления в обычном I триместре комбинированного скрининга на T21 (сывороточные маркеры β-ХГЧ и PAPP-A с ультразвуком): 88-89% (общий показатель T21 1: 700 беременностей).
Специфичность (Истинно-отрицательный/(Истинно-отрицательный + Ложно-положительный)):

T21 – 100%
T18 – 99.3%
T13 – 99.3%
X0 – 99.6%

Положительная прогнозирующая стоимость (PPV):

PPV = Истинно-положительный/(Истинно-положительный + Ложно-положительный)
Значение PPV для теста NIPTIFY в настоящее время не может быть определено, потому что не было обнаружено достаточно беременностей с трисомией.

Отрицательная прогнозирующая стоимость (NPV):

NPV = Истинно-отрицательный/(Истинно-отрицательный + Ложно-отрицательный)
NPV — 100% для всех трисомии.
Все методы NIPT невозможно выполнить, если в материнской плазме недостаточно фетальной cfDNA. Для NIPTIFY необходимо 4% cfDNA плода; в противном случае необходим новый образец для повторения теста. Во время клинической проверки cfDNA тестом NIPTIFY в восьми образцах было менее <4% (1,8%, 8/447). На этапе проверки повторная выборка не проводилась.

Аккредитация of NIPTIFY услуги

Лаборатория точной медицины будет аккредитована в соответствии с ISO 15189.

Внедряя услугу NIPTIFY, во внимание было приняты процедуры ISO, и действующие стандартные рабочие процедуры соответствуют требованиям ISO 15189.
Аккредитация находится в процессе и должна быть завершена осенью 2019 года. Поскольку метод является новым, мы хотим использовать опыт, подтверждающий обслуживание, в аккредитации ISO.

Наука, стоящая за технологиями NIPTIFY

Bayindir et al. (2015) Неинвазивное пренатальное тестирование с использованием нового конвейера анализа для выявления всех аутосомных анеуплоидий плода улучшает ведение беременности. Eur J Hum Genet 23(10):1286-93. doi: 10.1038/ejhg.2014.282. Прямая ссылка на статью.

Sauk et al. (2018) NIPTmer: быстрый пакет программ на основе k-mer для выявления анеуплоидий плода. Sci Rep. 8(1):5616. doi: 10.1038/s41598-018-23589-8. Прямая ссылка на статью.

Zhilina et al. (2018) Создание основы для внедрения NIPT в условиях общественного здравоохранения Эстонии. bioRxiv. doi: https://doi.org/10.1101/431924. Прямая ссылка на статью.